確定申告以外に税金関係でやらなければならない作業がわかりません。

年末調整と償却資産税の申告が必要になります。

(1) 年末調整

年末調整は、一年間の給与に対する所得税を計算して、毎月の給与の支給の時に預かっている所得税との差の金額を清算することです。
開業いたしますと、従業員さんに対してこの作業を必ず行う必要がでてきます。
また、年末調整の作業と並行して、「給与支払報告書」という書類を従業員さんの住所所在地の市区町村役所(役場)に送ることも忘れてはいけません。

(2) 償却資産
土地や建物には「固定資産税」、自動車には「自動車税」という税がかかるのと同じように、診療所のパソコン・内装・医療機器などの固定資産には「償却資産税」という税金がかかります。
償却資産税は1月31日までの申告が必要です。